1. Chỉ đạo, điều hành, quản lý chung mọi mặt hoạt động của Sở Y tế.
2. Là đầu mối liên hệ với Bộ Y tế, Tỉnh ủy, Hội đồng nhân dân tỉnh, Ủy ban nhân dân tỉnh.
3. Trực tiếp chỉ đạo các lĩnh vực công tác: Chính trị, tư tưởng, xây dựng Đảng, xây dựng chính quyền, bảo vệ chính trị nội bộ; tổ chức cán bộ, đào tạo, thi đua khen thưởng, kỷ luật; quy hoạch, kế hoạch phát triển ngành Y tế; kế hoạch, tài chính; xây dựng cơ bản, trang thiết bị y tế; thanh tra, giải quyết đơn khiếu nại, tố cáo, đơn kiến nghị, phản ánh; khám, chữa bệnh; pháp chế; bảo vệ, chăm sóc sức khỏe cán bộ; phòng chống tham nhũng, thực hành tiết kiệm và chống lãng phí.
4. Quyết định giao dự toán cho các đơn vị dự toán trực thuộc Sở Y tế; chủ tài khoản Cơ quan Sở Y tế.
5. Là người phát ngôn và cung cấp thông tin cho báo chí của Sở Y tế.
6. Theo dõi, chỉ đạo Phòng Kế hoạch – Tài chính, Thanh tra Sở Y tế; Bệnh viện Đa khoa tỉnh; Bệnh viện Đa khoa khu vực Ngọc Hồi; Trung tâm Kiểm soát bệnh tật; Trung tâm Y tế thành phố Kon Tum.
6. Tham gia các ban, hội đồng của tỉnh, của ngành thuộc trách nhiệm của Giám đốc Sở.